To malownicze stare miasto, jest jednym z najstarszych miast Europy. Zostało założone 3000 lat temu przez Traków i początkowo nosił nazwę Messambria.
W VI wieku p.n.e. miasto zostało kolonią grecką, powoli stawało się centrum handlowym i kulturalnym regionu. Wybudowano w mieście świątynię, teatr, a także uzyskano prawo bicia własnej monety.
Z tego okresu zostały fragmenty muru obronnego, który stanowił fortyfikację miasta.
Rzymianie zdobyli miasto w 7 1r. p.n.e., następnie przeszło we władanie Bizancjum i w tym okresie wybudowano liczne świątynie i nowe mury.
W roku 812 po dwóch tygodniach oblężenia miasto zostało zdobyte przez chana Kruma i już jako Nesebyr stało się częścią Państwa Bułgarskiego.
W roku 1453 miasto zdobywają Turcy i zostaje włączone do imperium osmańskiego co zapoczątkowało upadek miasta.
W XIX wieku Nesebyr stał się małym miasteczkiem, którego głównym środkiem utrzymania było rybołówstwo i rolnictwo.
Po 1959 roku kiedy na wybrzeżu Morza Czarnego powstał kurort wypoczynkowy Słoneczny Brzeg.
Nessebyr wykorzystał swoje położenie, warunki geograficzne i swoją historię. Miasto postawiło na rozwój turystyki, która rozwija się do dnia dzisiejszego.
Nesebyr to prawdziwa perełka architektoniczna, a o wyjątkowości tego miejsca świadczy to, że w 1983 został wpisany na Listę Światowego Dziedzictwa Kultury UNESCO.
Najciekawsze zabytki Nesebyru to wszystko to co pozostało z czasów starożytnych, mury miasta, ruiny Bazyliki, wyroby ceramiczne i pamiątki jeszcze z czasów Greków, cerkwie św. Apostołów, św. Jana Chrzciciela oraz pięknie zachowana zabudowa mieszkalna.
Nesebyr to obowiązkowy punkt każdego turysty odwiedzającego Bułgarię.